Manhattan Project: Energy Empire obsahuje kompletný obsah pôvodnej hry spolu s rozšírením Cold War, novým rozšírením UN Envoys a ďalším bonusovým obsahom.
Hra sa odohráva v druhej polovici 20. storočia, keď jednotlivé národy usilujú o rast svojho vplyvu a moci. Hráči preberajú kontrolu nad vlastným štátom a rozvíjajú jeho priemysel, obchod a vládne inštitúcie prostredníctvom získavania zdrojov, výstavby budov a využívania energetických zdrojov.
Najväčšou hrozbou v Energy Empire nie sú vojenské konflikty, ale globálne dôsledky industrializácie a znečistenia. Mnohé akcie prinášajú vedľajšie efekty v podobe rastúceho znečistenia, ktoré môže ovplyvniť priebeh hry. Využívanie vedy pomáha zmierňovať negatívne dopady priemyslu a prispieva k riešeniu globálnych kríz.
Hra využíva mechaniky worker placement, tableau-building a resource management. Počas svojho ťahu si hráč vyberá medzi akciou Work alebo Generate. Pri Work umiestňuje pracovníka na herný plán a aktivuje karty vo svojom hernom priestore pomocou pracovníkov a energie. Vďaka možnosti míňať energiu na obsadené polia nie sú akčné priestory nikdy úplne zablokované.
Pri akcii Generate si hráči obnovujú zásoby energie pomocou energy dice, ktoré reprezentujú rôzne zdroje energie vrátane jadrovej energie, uhlia, ropy, solárnej energie a ďalších foriem.
Obojstranný herný plán umožňuje plynulé spojenie základnej hry a rozšírenia do jedného komplexného herného zážitku. Obsah nového rozšírenia bol vytvorený exkluzívne pre toto vydanie a nie je dostupný samostatne.