Thunderbolt prenáša herný systém The Ancient World do obdobia 2. púnskej vojny. Hra zachytáva boje v západnom Stredomorí na mapách Talianska, Afriky a Španielska vrátane západnej Mauretánie. Súčasťou je rozsiahla kampaň aj viacero kratších scenárov.
Herný systém využíva mechaniku losovania žetónov, ktorá určuje poradie aktivácií veliteľov. Skúsenejší velitelia získavajú viac príležitostí konať. Pohyb armád ovplyvňuje opotrebovanie jednotiek a schopnosť veliteľov pokračovať v operáciách, zatiaľ čo bitky využívajú hod kockami a množstvo modifikátorov zohľadňujúcich jazdectvo, elitné jednotky, velenie aj počet vojakov. Hra obsahuje aj pravidlá pre zachytávanie nepriateľa, ústupy, prenasledovanie, obliehania či náhodné udalosti označované ako Auguries.
Veľký dôraz je kladený na politické systémy Ríma a Kartága. Rímski magistráti, ako konzuli, prokonzuli, prétori alebo diktátor, velia légiám podľa svojich historických schopností a rozhodnutí Senátu. Kartágo využíva vlastnú hierarchiu veliteľov a politický systém, ktorý ovplyvňuje počet armád aj možnosti vedenia vojny. Výnimkou je Hannibal, ktorý sa môže pohybovať nezávisle od týchto obmedzení.
Novinkou systému sú keltské a ďalšie kmene na Pyrenejskom polostrove a v severnom Taliansku. Hráči môžu pomocou diplomacie získavať ich podporu, verbovať jednotky alebo ich vojensky pacifikovať. Námorné operácie využívajú zjednodušený systém Naval Superiority System.
Hra obsahuje veľkú kampaň pokrývajúcu celú 2. púnsku vojnu aj množstvo samostatných scenárov vrátane Hannibal's Invasion of Italy, Italian Campaign, The Spanish Campaign, The African Campaign a ďalších.
Obsah balenia